To záleží pouze na tobě. Ovšem pokud je tam něco k řízení, pochybuju, že by to nezvládl MCU. Už vzhledem ke spotřebě a stabilitě bych nepoužíval PC jako hlavní řídicí systém. Samozřejmě se nechá udělat PC (relativně) spolehlivé, ale nemyslím, že to bude tvůj případ.