Klidně jsi mohl pokračovat v původním vlákně, ale nevadí. Pořiď si USBasp programátor. Na AliExpress se dá pořídit cca za 30 Kč. K němu si stáhni software - na stránce fischl.de/usbasp/ jsou dokonce 4 různé programy, kterými lze HEX do procesoru nahrát. Vyzkoušený mám jenom eXtreme Burner. Dá se jednoduše rozšiřovat o procesory, které nejsou při instalaci k dispozici (jednoduchý XML soubor s parametrama).
Když se zeptáš strejdy Googla, tak Ti určitě poradí i jak zaintegrovat podporu pro USBasp programátor přímo jako externí tool pro Atmel Studio, ale myslím si, že použít Atmel Studio na vytvoření programu a HEX souboru s následním vypálením do procesoru pomocí eXtreme Burner (nebo kteréhokoliv jiného programu spolupracujícím s USBasp) “externě” asi nebude tak velký problém.