Neznám avr studio 5 - používám 4.18 a ten to co chceš určitě za běhu neumí
jediná možnost je v místě, kde testuješ dokončení převodu dát break point a pak můžeš měnit co chceš.
A nebo investuj do nějakého JTAG OCD(ICD) - (on chip/in circuit - podle výrobce- debuggeru.
Slušný a ne moc drahý je AVR dragon.
Nebo na ebay je plno JTAG ICE za pár korun - ale spolehlivost odpovídá ceně - doma se mi válí dva co fungovaly jen jeden den.