Problém s přerušením (?) blikání LED časovačem, občas nejde

Ne nejde to. JE to blbost.
&= použít můžeš, ale přeber si jak funguje AND.
Tedy když chceš nulovat třeba PC6, musíš takto:
PORTC &= 0b10111111
nebo
PORTC &= ~(1<<PC6)
Ale tohle ti tu myslím už napsali.